240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2148 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2148  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  988    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2122  hypothetical protein  96.75 
 
 
493 aa  959    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1932  amino acid/peptide transporter  40.58 
 
 
536 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000463259  hitchhiker  0.00239553 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0006  hypothetical protein  41.25 
 
 
484 aa  361  1e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.28636  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0003  hypothetical protein  39.5 
 
 
484 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.992067  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1493  hypothetical protein  39.71 
 
 
495 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1490  hypothetical protein  39.71 
 
 
495 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2116  di-/tripeptide transporter  34.73 
 
 
492 aa  298  1e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  26.48 
 
 
501 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  26.48 
 
 
501 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  26.27 
 
 
501 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  26.27 
 
 
501 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  26.27 
 
 
501 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  24.42 
 
 
506 aa  160  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  26 
 
 
500 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  26.88 
 
 
510 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  26 
 
 
500 aa  157  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  26 
 
 
500 aa  157  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  26 
 
 
500 aa  156  7e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  26 
 
 
500 aa  156  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  26 
 
 
500 aa  156  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  26 
 
 
500 aa  156  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  26 
 
 
500 aa  156  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  26 
 
 
500 aa  156  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  24.58 
 
 
506 aa  154  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  26.07 
 
 
510 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  25.47 
 
 
502 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  24.4 
 
 
500 aa  150  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  24.2 
 
 
500 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  24.69 
 
 
495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  26.11 
 
 
495 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  25.16 
 
 
490 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  23.28 
 
 
482 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  24.28 
 
 
514 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  26.09 
 
 
507 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  26.23 
 
 
501 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  26 
 
 
489 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  25.79 
 
 
489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  25.79 
 
 
489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  25.79 
 
 
489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  25.79 
 
 
489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  25.79 
 
 
489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  25.79 
 
 
489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  25.79 
 
 
489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2719  inner membrane transporter YbgH  24.63 
 
 
486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.945342  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2761  inner membrane transporter YbgH  24.63 
 
 
486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2936  inner membrane transporter YbgH  24.63 
 
 
486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2802  inner membrane transporter YbgH  24.63 
 
 
486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.883594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2823  inner membrane transporter YbgH  24.63 
 
 
486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  24.07 
 
 
527 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  25.58 
 
 
490 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  25.58 
 
 
490 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  25.58 
 
 
490 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  25.58 
 
 
490 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  25.58 
 
 
489 aa  140  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  26.22 
 
 
509 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  24.38 
 
 
492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  23.95 
 
 
492 aa  133  9e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  23.93 
 
 
499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  24.34 
 
 
511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  24.34 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4599  amino acid/peptide transporter  25.89 
 
 
485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148198  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  24.34 
 
 
488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  25.68 
 
 
485 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4685  amino acid/peptide transporter  25.68 
 
 
485 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03963  hypothetical protein  25.68 
 
 
485 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3861  amino acid/peptide transporter  25.68 
 
 
485 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3897  amino acid/peptide transporter  25.68 
 
 
485 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  25.68 
 
 
485 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5646  amino acid/peptide transporter  25.47 
 
 
485 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  24.7 
 
 
499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  25.06 
 
 
477 aa  130  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  26.1 
 
 
513 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  24.44 
 
 
506 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  22.56 
 
 
516 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  23.43 
 
 
489 aa  127  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  25.87 
 
 
461 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  24.12 
 
 
496 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  24.23 
 
 
494 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  22.24 
 
 
516 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  26.33 
 
 
461 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  26.11 
 
 
461 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  22.32 
 
 
493 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  24.8 
 
 
497 aa  123  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  22.32 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  24.4 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  22.32 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  22.27 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  22.32 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  22.32 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  24.44 
 
 
497 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0799  amino acid/peptide transporter  23.84 
 
 
493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.256216  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  24.49 
 
 
502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0724  amino acid/peptide transporter  24.07 
 
 
493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470702  normal  0.430255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00669  predicted transporter  23.84 
 
 
493 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2927  amino acid/peptide transporter  23.84 
 
 
493 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00658  hypothetical protein  23.84 
 
 
493 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0757  amino acid/peptide transporter  23.84 
 
 
493 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0734  amino acid/peptide transporter  23.84 
 
 
493 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2946  amino acid/peptide transporter  23.84 
 
 
493 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>