More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2503 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1035  transketolase central region  53.53 
 
 
747 aa  780    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2633  hypothetical protein  98.39 
 
 
745 aa  1516    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2503  hypothetical protein  100 
 
 
745 aa  1538    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1294  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  50.76 
 
 
727 aa  727    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0901  transketolase, central region  51.42 
 
 
763 aa  769    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.542357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3884  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  52.94 
 
 
735 aa  776    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2795  transketolase, central region  51.08 
 
 
761 aa  748    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1045  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  51.9 
 
 
738 aa  749    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3017  transketolase, central region  51.08 
 
 
761 aa  754    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2640  Transketolase domain protein  51.29 
 
 
759 aa  713    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2962  transketolase, central region  53.42 
 
 
733 aa  783    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0290304  normal  0.0965541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2156  transketolase central region  48.63 
 
 
790 aa  657    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2566  putative bifunctional enzyme  50.89 
 
 
743 aa  736    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000104347  hitchhiker  0.000000000000144647 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2954  transketolase, central region  50.41 
 
 
727 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.998903  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2727  transketolase, central region  50.62 
 
 
727 aa  736    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.556431  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6420  2-oxoisovalerate dehydrogenase  47.9 
 
 
736 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00562183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1956  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  44.99 
 
 
721 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.224438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2022  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  44.73 
 
 
721 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556137  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1976  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.42 
 
 
687 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611209  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3370  transketolase domain-containing protein  43.12 
 
 
792 aa  597  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3610  transketolase domain-containing protein  43.33 
 
 
805 aa  595  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  28.59 
 
 
736 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  28.41 
 
 
710 aa  216  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05225  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  25.91 
 
 
688 aa  195  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.737912  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  28.25 
 
 
678 aa  191  5e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1538  Transketolase central region  27.81 
 
 
681 aa  188  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.244278  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0762  transketolase domain-containing protein  28.79 
 
 
692 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4110  transketolase domain-containing protein  28.08 
 
 
692 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3123  transketolase domain-containing protein  27.49 
 
 
701 aa  175  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523599 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  33.84 
 
 
327 aa  171  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1549  Transketolase domain protein  27.44 
 
 
709 aa  170  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  34.22 
 
 
320 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  33.92 
 
 
325 aa  170  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  35.56 
 
 
320 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0476  Transketolase central region  36.17 
 
 
320 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000162173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  32.84 
 
 
325 aa  163  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  32.85 
 
 
325 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  27.94 
 
 
617 aa  163  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2899  transketolase, central region  36.59 
 
 
320 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1604  transketolase, central region  29.87 
 
 
693 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167534  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  31.16 
 
 
325 aa  161  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  27.27 
 
 
668 aa  160  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  31.16 
 
 
325 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  30.97 
 
 
325 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  30.97 
 
 
325 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  30.97 
 
 
325 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  34.65 
 
 
336 aa  159  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  30.97 
 
 
325 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  30.97 
 
 
325 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  30.97 
 
 
325 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  30.97 
 
 
325 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  33.23 
 
 
326 aa  159  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  31.55 
 
 
325 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  30.97 
 
 
325 aa  158  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  31.45 
 
 
326 aa  158  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  32.24 
 
 
325 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  33.93 
 
 
324 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  32.54 
 
 
339 aa  157  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  34.03 
 
 
325 aa  156  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7268  transketolase central region  33.43 
 
 
388 aa  156  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.801653  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  34.03 
 
 
325 aa  156  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  27.04 
 
 
702 aa  156  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0781  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  34.65 
 
 
337 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1330  transketolase, central region  33.43 
 
 
343 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0296032  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  33.23 
 
 
341 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  33.52 
 
 
351 aa  154  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2904  Transketolase central region  32.15 
 
 
373 aa  154  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  31.96 
 
 
338 aa  154  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  26.6 
 
 
680 aa  154  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  32.13 
 
 
322 aa  154  7e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  32.84 
 
 
325 aa  153  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  31.2 
 
 
326 aa  153  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  26.67 
 
 
659 aa  153  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0057  transketolase  32.63 
 
 
353 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  32.1 
 
 
348 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  34.34 
 
 
330 aa  152  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2777  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  34.25 
 
 
337 aa  152  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.222973  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1871  transketolase central region  32.62 
 
 
337 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0705  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  31.96 
 
 
337 aa  152  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346311  normal  0.842188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  32.94 
 
 
335 aa  151  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  33.63 
 
 
328 aa  151  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3192  transketolase, central region  31.66 
 
 
370 aa  151  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  32.83 
 
 
324 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  32.83 
 
 
324 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  26.7 
 
 
657 aa  150  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  32.84 
 
 
324 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  32.26 
 
 
326 aa  150  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5002  Transketolase central region  32.85 
 
 
325 aa  150  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00992852  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  32.13 
 
 
342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1135  Transketolase central region  32.83 
 
 
324 aa  150  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.323286  normal  0.423895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5310  Transketolase central region  33.91 
 
 
335 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  30.95 
 
 
354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  33.74 
 
 
325 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2510  transketolase-like  31.61 
 
 
320 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.703307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0274  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  31.21 
 
 
336 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.724855  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  33.14 
 
 
346 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  32.21 
 
 
332 aa  149  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3464  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  31.48 
 
 
352 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  33.53 
 
 
326 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  25.79 
 
 
658 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>