55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1073 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  56.7 
 
 
631 aa  643    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  74.61 
 
 
582 aa  924    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  100 
 
 
591 aa  1226    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  40.55 
 
 
911 aa  449  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  36.86 
 
 
955 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  37.44 
 
 
953 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  37.44 
 
 
950 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  37.54 
 
 
950 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  37.44 
 
 
958 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  37.44 
 
 
958 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  37.44 
 
 
953 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  37.44 
 
 
955 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  39.37 
 
 
895 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  38.9 
 
 
689 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  38.7 
 
 
890 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  38.7 
 
 
890 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  69.02 
 
 
280 aa  350  3e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  37.64 
 
 
580 aa  322  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  53.82 
 
 
295 aa  318  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  37.13 
 
 
930 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  36.64 
 
 
676 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  36.91 
 
 
633 aa  311  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  35.58 
 
 
845 aa  300  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  36.02 
 
 
658 aa  293  6e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  32.73 
 
 
979 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  34.03 
 
 
841 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  36.67 
 
 
627 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  33.6 
 
 
515 aa  267  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  31.3 
 
 
899 aa  233  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  32.9 
 
 
878 aa  233  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  32.45 
 
 
1051 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  30.36 
 
 
929 aa  223  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  33.18 
 
 
556 aa  219  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  33.26 
 
 
574 aa  217  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  30.35 
 
 
711 aa  213  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  30.97 
 
 
713 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  29.41 
 
 
553 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2286  hypothetical protein  66.07 
 
 
125 aa  157  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  28.25 
 
 
443 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  35 
 
 
383 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  26.81 
 
 
842 aa  97.4  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  25.53 
 
 
580 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  44.76 
 
 
134 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  27.33 
 
 
597 aa  77.4  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  32.96 
 
 
597 aa  75.1  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  32.96 
 
 
597 aa  75.1  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  27.27 
 
 
897 aa  74.3  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  27.16 
 
 
709 aa  71.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  26.54 
 
 
987 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.31 
 
 
970 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  26.14 
 
 
970 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  34.53 
 
 
298 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  34.53 
 
 
298 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  28.19 
 
 
624 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2724  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>