142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3239 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3239  recombination regulator RecX  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3374  recombination regulator RecX  97.33 
 
 		 187 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  69.83 
 
 		 168 aa  249  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1115  recombination regulator RecX  50.56 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.082159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3212  recombination regulator RecX  51.4 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  48.6 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  45.66 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  45.66 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2821  recombination regulator RecX  45.66 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0625377  decreased coverage  0.00000261064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02548  RecA regulator RecX  45.66 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300656  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0991  regulatory protein RecX  45.66 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2834  recombination regulator RecX  45.66 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00753418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1014  recombination regulator RecX  45.66 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360041 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02513  hypothetical protein  45.66 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3179  recombination regulator RecX  45.09 
 
 		 166 aa  147  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00424518  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0982  recombination regulator RecX  44.69 
 
 		 162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  43.93 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2947  recombination regulator RecX  43.93 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.758881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3137  recombination regulator RecX  43.93 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  hitchhiker  0.000324219 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2979  recombination regulator RecX  43.93 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364675  decreased coverage  0.0000769144 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3030  recombination regulator RecX  43.35 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00516229  hitchhiker  0.000218758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3014  recombination regulator RecX  43.35 
 
 		 166 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000680655 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  37.35 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  32.94 
 
 		 149 aa  90.9  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  34.91 
 
 		 145 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  32.16 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  32.75 
 
 		 153 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  31.03 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  32.16 
 
 		 155 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  30.41 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  35.4 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  32.54 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  34.78 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  29.94 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00148  recombination regulator RecX  29.82 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0909326  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02827  hypothetical protein  36.89 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06801  hypothetical protein  36.89 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  40.82 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  30.18 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1304  recombination regulator RecX  31.25 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  39.81 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  29.41 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  29.82 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  30.41 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  28.14 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  29.82 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3125  regulatory protein RecX  36.61 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3268  regulatory protein RecX  36.61 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3116  regulatory protein RecX  36.61 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2746  regulatory protein RecX  35.71 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  29.7 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  36.61 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  30.77 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  27.93 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  31.64 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  26.9 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  27.68 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  29.05 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3016  regulatory protein RecX  40.91 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  26.26 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  29.82 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  29.34 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1832  regulatory protein RecX  29.89 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  33.72 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0672  regulatory protein RecX  33.14 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  28.92 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  29.94 
 
 		 138 aa  62  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1548  regulatory protein RecX  31.29 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000023294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  27.16 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  27.44 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  25.86 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1051  regulatory protein RecX  30.85 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0599786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  34.82 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0933  regulatory protein RecX  30.85 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2040  recombination regulator RecX  30.99 
 
 		 297 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2651  recombination regulator RecX  30.99 
 
 		 297 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  35.29 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4151  regulatory protein RecX  28.49 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  28.82 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  29.46 
 
 		 153 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0703  regulatory protein RecX  33.64 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1126  regulatory protein RecX  32.11 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  30.51 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0552  recombination regulator RecX  27.01 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1127  regulatory protein RecX  33.94 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  37.14 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  30.17 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3429  regulatory protein RecX  32.74 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0528  recombination regulator RecX  28.07 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00754387  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5978  recombination regulator RecX  31.58 
 
 		 289 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.129399 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0644  recombination regulator RecX  28.49 
 
 		 325 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3955  regulatory protein RecX  25.99 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  30.99 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0456  recombination regulator RecX  26.11 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0441  regulatory protein RecX  28.9 
 
 		 262 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2669  regulatory protein recX  31.58 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3947  regulatory protein RecX  26.59 
 
 		 153 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2403  recombination regulator RecX  34.26 
 
 		 327 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0811  recombination regulator RecX  34.26 
 
 		 327 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0815  recombination regulator RecX  34.78 
 
 		 327 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>