182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1511 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  100 
 
 
163 aa  321  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  100 
 
 
158 aa  320  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  99.37 
 
 
163 aa  318  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  68.18 
 
 
160 aa  230  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  65.58 
 
 
160 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  64.94 
 
 
160 aa  209  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  65.38 
 
 
161 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  65.38 
 
 
161 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  65.38 
 
 
161 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  65.38 
 
 
161 aa  204  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  64.29 
 
 
162 aa  204  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  65.38 
 
 
161 aa  203  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  63.46 
 
 
161 aa  199  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  63.46 
 
 
161 aa  197  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  63.46 
 
 
161 aa  197  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  63.46 
 
 
161 aa  197  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  63.46 
 
 
161 aa  197  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  63.46 
 
 
161 aa  197  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  63.46 
 
 
161 aa  197  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  63.46 
 
 
161 aa  197  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  63.46 
 
 
161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  63.46 
 
 
161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  63.64 
 
 
161 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  45.03 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.95 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.758987 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.87 
 
 
156 aa  120  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.11 
 
 
156 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.45 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.45 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.45 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  41.45 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  42.11 
 
 
156 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.87 
 
 
156 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  43.87 
 
 
156 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1534  phosphohistidine phosphatase SixA  41.45 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.75 
 
 
157 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2810  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.38 
 
 
158 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2591  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.82 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3020  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.79 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1635  phosphohistidine phosphatase, SixA  40.94 
 
 
162 aa  112  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  39.33 
 
 
154 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2162  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  43.8 
 
 
156 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  38.82 
 
 
154 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  42.38 
 
 
157 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  37.04 
 
 
166 aa  100  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0731  phosphohistidine phosphatase  38.17 
 
 
181 aa  93.2  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  38 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1667  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.88 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2096  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.57 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0001187  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.55 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.7 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  37.04 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3657  phosphohistidine phosphatase SixA  37.04 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  37.04 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.07 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43620  putative phosphohistidine phosphatase SixA  35.56 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.01886  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.07 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.85 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.33 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.07 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.37 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0932  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.89 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.830676  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.7 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.44 
 
 
176 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.8 
 
 
159 aa  61.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  35.82 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  34.31 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
150 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.54 
 
 
169 aa  57.4  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.88 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.41 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.82 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.37 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.01 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.01 
 
 
165 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.53 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1215  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.48 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.94 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.26 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0781  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.65 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  31.11 
 
 
152 aa  54.3  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1581  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.97 
 
 
166 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.85 
 
 
149 aa  53.9  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2157  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.89 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0582  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.016347  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.77 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.43 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  29.03 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2175  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2377  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.62 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.61 
 
 
152 aa  51.2  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1220  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.61 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1481  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.76 
 
 
154 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.88 
 
 
174 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.77 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.04 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.89 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0613  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.12 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.639252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>