More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1837 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  100 
 
 		 305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  61.44 
 
 		 297 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  61.76 
 
 		 297 aa  332  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  54.93 
 
 		 298 aa  316  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  56.44 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  54.13 
 
 		 296 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  54.79 
 
 		 293 aa  310  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  54.67 
 
 		 296 aa  309  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  56 
 
 		 292 aa  308  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  54.82 
 
 		 293 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  57.38 
 
 		 294 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  54.13 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  54.82 
 
 		 293 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  55.96 
 
 		 293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  54 
 
 		 288 aa  305  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  53 
 
 		 296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  53.47 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  54.49 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  53.49 
 
 		 293 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  53.62 
 
 		 294 aa  298  8e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  53.95 
 
 		 299 aa  296  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  52.82 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  51.13 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  48.68 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  46.47 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  49.34 
 
 		 300 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  48.54 
 
 		 301 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  48.54 
 
 		 296 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  52.46 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  50.33 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  53.7 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  53.07 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  53.07 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  50.76 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  45.87 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  45.07 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  45.39 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  44.82 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  47.06 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  39.66 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  43.81 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  42.72 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  43.37 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  43.81 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  40.2 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  44.55 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  37.29 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  42.72 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  41.81 
 
 		 304 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  48.74 
 
 		 278 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  41.36 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  43.67 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  43.14 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  42.26 
 
 		 305 aa  208  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  40.77 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  42.33 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  44.78 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  42.74 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  40.85 
 
 		 284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  41.64 
 
 		 307 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  42.39 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  40.79 
 
 		 314 aa  199  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  45.66 
 
 		 269 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  41.99 
 
 		 298 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  41 
 
 		 284 aa  198  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  41.99 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  44.65 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  41.4 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  45 
 
 		 287 aa  195  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  39.02 
 
 		 295 aa  195  9e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  42.05 
 
 		 289 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  42.81 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  37.42 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  40.92 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  42.42 
 
 		 295 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  41.5 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  41.5 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  39.8 
 
 		 289 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  41.84 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4977  parB-like partition protein  40.63 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  41.06 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  41.08 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  40.76 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4693  chromosome segregation DNA-binding protein  42.31 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  38.72 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3110  chromosome segregation DNA-binding protein  40.74 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.444116  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  40.13 
 
 		 303 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4808  parB-like partition protein  37.74 
 
 		 322 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  39.07 
 
 		 293 aa  189  7e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  38.31 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23400  ParB-like partition protein  39.7 
 
 		 268 aa  188  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  40.6 
 
 		 321 aa  188  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  40.72 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  41.41 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  40.92 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  40.75 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  38.54 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  40.62 
 
 		 328 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  42.38 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  40.92 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>