33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1748 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1748  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1157 aa  2298    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2660  hypothetical protein  37.12 
 
 		 564 aa  327  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_003296  RS00388  putative signal peptide protein  35.56 
 
 		 585 aa  283  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.052584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3617  putative signal peptide protein  35.29 
 
 		 574 aa  270  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4694  conserved hypothetical signal peptide protein  35.29 
 
 		 574 aa  270  8e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0218305  normal  0.0355925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1029  peptidase aspartic, active site  32.87 
 
 		 654 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1193  hypothetical protein  31.87 
 
 		 654 aa  240  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3173  tetratricopeptide TPR_4  40.87 
 
 		 937 aa  237  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2942  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 955 aa  122  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297804  normal  0.363556 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0568  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 940 aa  116  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0632734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4127  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 655 aa  63.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.206732 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 878 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2725  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 856 aa  60.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2933  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  26 
 
 		 1000 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863782  normal  0.205822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2487  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  26.27 
 
 		 1001 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0641  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  23.74 
 
 		 990 aa  54.7  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.369188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3450  hypothetical protein  25.85 
 
 		 879 aa  54.7  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0581  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  23.74 
 
 		 990 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3084  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  23.74 
 
 		 990 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0585  bacteriophage N4 receptor, outer membrane subunit  23.74 
 
 		 990 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.84 
 
 		 810 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3061  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 990 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  23.36 
 
 		 1213 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 927 aa  52  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 767 aa  50.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  26.86 
 
 		 652 aa  49.7  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  27.78 
 
 		 1073 aa  48.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  33.73 
 
 		 539 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1370  hypothetical protein  28.66 
 
 		 690 aa  46.6  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1304  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 690 aa  46.2  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 883 aa  45.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  41.89 
 
 		 435 aa  45.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 321 aa  44.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>