63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2929 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2929  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 
168 aa  330  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.105742  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2115  hemerythrin-like metal-binding protein  48.09 
 
 
152 aa  137  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.13266  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0248  hemerythrin-like metal-binding protein  52.63 
 
 
146 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0674863  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4804  hemerythrin-like metal-binding protein  43.62 
 
 
158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0345942  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3521  hypothetical protein  49.63 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0784329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2787  hemerythrin-like metal-binding protein  48.89 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.107285 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4966  hemerythrin-like metal-binding protein  48.89 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2081  hemerythrin-like metal-binding protein  54.2 
 
 
147 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2762  hemerythrin HHE cation binding region  48.85 
 
 
146 aa  127  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0967161  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0584  hypothetical protein  48.51 
 
 
165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00144915  normal  0.452877 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0962  hypothetical protein  47.41 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4879  hemerythrin-like metal-binding protein  43.28 
 
 
147 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4628  hemerythrin-like metal-binding protein  44.7 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  37.59 
 
 
161 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0777  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.07 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0138486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  39.13 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0256  hemerythrin-like metal-binding protein  35.25 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0382967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0251  hemerythrin-like metal-binding protein  35.25 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1243  hemerythrin-like metal-binding protein  36.52 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123375  normal  0.910299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  37.39 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0314  hemerythrin-like metal-binding protein  36.51 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  40.37 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1625  hemerythrin-like metal-binding protein  37.5 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000638353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0371  hemerythrin-like metal-binding protein  35.85 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1420  hypothetical protein  38.26 
 
 
125 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2637  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.52 
 
 
160 aa  62  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01310  hemerythrin-like, metal binding protein  34.43 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0820  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.33 
 
 
157 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1720  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.08 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0605  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.08 
 
 
149 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2769  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.08 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2711  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.08 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2882  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.08 
 
 
149 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2407  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.08 
 
 
149 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2831  cation-binding hemerythrin HHE family protein  32.08 
 
 
186 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1789  cation-binding hemerythrin HHE family protein  33.02 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0880255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  25.3 
 
 
133 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0492  hemerythrin-like, metal-binding protein  35.09 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  21.43 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0525  hemerythrin-like metal-binding protein  32.81 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 
135 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  26.92 
 
 
90 aa  44.3  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  25.78 
 
 
529 aa  44.3  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1969  hemerythrin-like metal-binding protein  27.62 
 
 
129 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  23.42 
 
 
135 aa  44.3  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  23.28 
 
 
135 aa  44.3  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0520  hemerythrin-like metal-binding protein  32.03 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  25.19 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  29.13 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.56 
 
 
518 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.22 
 
 
529 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  27.05 
 
 
360 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.22 
 
 
529 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3052  hemerythrin-like metal-binding protein  29.69 
 
 
142 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129112  normal  0.291698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23 
 
 
515 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  31.58 
 
 
133 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  26.67 
 
 
131 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  31.58 
 
 
133 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.58 
 
 
133 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.44 
 
 
529 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  20.61 
 
 
135 aa  40.8  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22 
 
 
515 aa  40.8  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.23 
 
 
147 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>