More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2615 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2615  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 246 aa  511  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.328239 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6683  UvrD/REP helicase  51.44 
 
 		 966 aa  217  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0759039  normal  0.87543 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.7 
 
 		 785 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  31.63 
 
 		 758 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 707 aa  101  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  33.49 
 
 		 759 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  32.09 
 
 		 742 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 807 aa  99  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.98 
 
 		 754 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.95 
 
 		 741 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.13 
 
 		 747 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.97 
 
 		 673 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.3 
 
 		 763 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.6 
 
 		 747 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  32.7 
 
 		 751 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.6 
 
 		 751 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  29.38 
 
 		 724 aa  96.3  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.6 
 
 		 751 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.6 
 
 		 747 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  31.6 
 
 		 753 aa  95.9  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.6 
 
 		 753 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.6 
 
 		 753 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  31.6 
 
 		 751 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.6 
 
 		 751 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  32.21 
 
 		 735 aa  95.5  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  31.17 
 
 		 726 aa  95.1  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  29.8 
 
 		 741 aa  95.1  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.41 
 
 		 1023 aa  95.1  9e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  29.19 
 
 		 770 aa  95.1  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  31.13 
 
 		 723 aa  94.7  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  29.86 
 
 		 760 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  30.77 
 
 		 706 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.67 
 
 		 762 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.11 
 
 		 876 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.81 
 
 		 741 aa  93.2  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  30.77 
 
 		 735 aa  93.2  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  30.37 
 
 		 646 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  28.85 
 
 		 739 aa  92.8  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.19 
 
 		 715 aa  92.8  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.86 
 
 		 759 aa  92  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.29 
 
 		 851 aa  92  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.73 
 
 		 765 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.33 
 
 		 730 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.33 
 
 		 730 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.63 
 
 		 694 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.19 
 
 		 758 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  29.33 
 
 		 743 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  30.23 
 
 		 783 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  27.96 
 
 		 735 aa  90.9  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  30.66 
 
 		 817 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2092  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.77 
 
 		 783 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0227682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.91 
 
 		 732 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.66 
 
 		 838 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  29.77 
 
 		 786 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  29.81 
 
 		 779 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  29.72 
 
 		 738 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30 
 
 		 864 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.29 
 
 		 729 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 625 aa  90.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  29.3 
 
 		 946 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  29.3 
 
 		 946 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.41 
 
 		 711 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.58 
 
 		 718 aa  89.7  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  29.11 
 
 		 743 aa  89.7  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.17 
 
 		 751 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.25 
 
 		 738 aa  89.4  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  29.25 
 
 		 738 aa  89.4  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  29.19 
 
 		 743 aa  89.4  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.1 
 
 		 814 aa  89.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  31.44 
 
 		 688 aa  89  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.17 
 
 		 751 aa  89  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5130  DNA-dependent helicase II  29.19 
 
 		 729 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.228367 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  32.06 
 
 		 668 aa  89  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3012  UvrD/REP helicase  31.31 
 
 		 770 aa  89  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.853588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  28.71 
 
 		 727 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.29 
 
 		 773 aa  88.6  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  29.69 
 
 		 678 aa  88.6  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  29.81 
 
 		 829 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  26.92 
 
 		 721 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  26.92 
 
 		 721 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.33 
 
 		 772 aa  88.2  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  28.85 
 
 		 812 aa  87.8  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.77 
 
 		 739 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.57 
 
 		 797 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.86 
 
 		 639 aa  87  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  30.7 
 
 		 705 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1488  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 659 aa  87.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.25 
 
 		 817 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  28.23 
 
 		 727 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  26.12 
 
 		 757 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  27.6 
 
 		 762 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  31.19 
 
 		 717 aa  86.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  29.26 
 
 		 678 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0595  UvrD/REP helicase  31.46 
 
 		 790 aa  86.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.97 
 
 		 831 aa  86.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  29.19 
 
 		 723 aa  86.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  29.24 
 
 		 731 aa  86.3  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.64 
 
 		 730 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  28.84 
 
 		 706 aa  86.3  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.57 
 
 		 795 aa  85.9  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>