More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5460 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5460  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 450 aa  902    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0033  major facilitator transporter  60.54 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864022  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5847  major facilitator transporter  64.45 
 
 		 455 aa  528  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.677532  hitchhiker  0.000346248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  54.91 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  52.98 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  52.72 
 
 		 440 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  51.5 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5345  major facilitator superfamily MFS_1  50.91 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12669  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5038  major facilitator transporter  50 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178058  hitchhiker  0.00357896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  47.02 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  45.23 
 
 		 443 aa  382  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  45.13 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  46.19 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  45.87 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  44.08 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  46.38 
 
 		 434 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  46.14 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  45.89 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  45.89 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  46.62 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  45.17 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  46.62 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  45.89 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  45.89 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  45.89 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  45.27 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  45.89 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  46.62 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  46.91 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  44.52 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  44.1 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  46.89 
 
 		 442 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  42.52 
 
 		 454 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 437 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  45.31 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.34 
 
 		 439 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  42.96 
 
 		 451 aa  359  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 		 444 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  44.47 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4532  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 454 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  44.23 
 
 		 433 aa  355  6.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 		 445 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 433 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5076  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 477 aa  353  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.924279  normal  0.0437029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 436 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 436 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  45.05 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  44.82 
 
 		 441 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 436 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 448 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 445 aa  349  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6694  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 448 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6459  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 448 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0184328  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  44.87 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 441 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  43.26 
 
 		 435 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  44.09 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1710  major facilitator transporter  45.18 
 
 		 449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0430  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.86 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.723134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  45 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  41.97 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  46.19 
 
 		 424 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 442 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 441 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 428 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4062  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 456 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42038  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 441 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1635  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000373492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4304  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 456 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.72099  normal  0.474261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3722  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 459 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390654  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 		 462 aa  338  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  43.26 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  43.26 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  43.26 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  43.26 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  43.26 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3214  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  43.26 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  40.6 
 
 		 440 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  43.02 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>