More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3261 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3261  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
212 aa  423  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1906  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  91.47 
 
 
211 aa  390  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3126  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  92.42 
 
 
213 aa  388  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.859515  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  91.04 
 
 
212 aa  384  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  89.15 
 
 
212 aa  381  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  88.73 
 
 
213 aa  381  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  89.15 
 
 
212 aa  381  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4265  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  89.15 
 
 
212 aa  377  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0745238  normal  0.356459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1652  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  87.2 
 
 
211 aa  370  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  86.26 
 
 
211 aa  367  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  86.73 
 
 
212 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  82.55 
 
 
212 aa  355  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1457  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  83.89 
 
 
212 aa  353  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0588304  normal  0.817341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  80.19 
 
 
212 aa  343  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  79.72 
 
 
212 aa  342  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  79.43 
 
 
216 aa  340  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  78.47 
 
 
216 aa  339  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  79.62 
 
 
212 aa  337  7e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  78.2 
 
 
213 aa  323  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  77.73 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  77.73 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  77.73 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  77.73 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  77.73 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  77.73 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  77.73 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  76.78 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.73 
 
 
213 aa  321  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.25 
 
 
213 aa  321  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  78.2 
 
 
213 aa  321  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  77.25 
 
 
213 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  77.73 
 
 
213 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.73 
 
 
213 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.73 
 
 
213 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.25 
 
 
213 aa  318  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  75.36 
 
 
209 aa  317  7e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  76.3 
 
 
213 aa  315  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  74.41 
 
 
209 aa  308  5e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.3 
 
 
210 aa  306  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  74.75 
 
 
202 aa  296  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.42 
 
 
209 aa  295  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.95 
 
 
209 aa  294  6e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  70.42 
 
 
209 aa  294  6e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.1 
 
 
219 aa  285  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2341  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.45 
 
 
208 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.09 
 
 
208 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  65.24 
 
 
218 aa  275  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.51 
 
 
214 aa  275  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  64.49 
 
 
216 aa  272  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.35 
 
 
218 aa  272  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.14 
 
 
214 aa  272  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.98 
 
 
218 aa  271  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.98 
 
 
221 aa  270  9e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.79 
 
 
219 aa  270  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5857  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.14 
 
 
221 aa  270  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3044  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.14 
 
 
241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3146  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.14 
 
 
219 aa  267  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.346959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2920  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.67 
 
 
219 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5000  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.29 
 
 
220 aa  267  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  hitchhiker  0.00178091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  65.42 
 
 
211 aa  267  8.999999999999999e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.88 
 
 
217 aa  266  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6365  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.73 
 
 
221 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457042  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.38 
 
 
215 aa  265  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.62 
 
 
214 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.87 
 
 
224 aa  262  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.74 
 
 
226 aa  261  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3109  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.57 
 
 
209 aa  261  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0179198  normal  0.0278919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.57 
 
 
221 aa  261  6.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3824  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.4 
 
 
212 aa  261  8e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1913  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.57 
 
 
209 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160848  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4888  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.77 
 
 
220 aa  260  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544225  normal  0.033457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.11 
 
 
236 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.51 
 
 
215 aa  259  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1005  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.19 
 
 
207 aa  258  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.282605  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0563  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.09 
 
 
209 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0647  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.64 
 
 
227 aa  257  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.38 
 
 
218 aa  257  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.74 
 
 
215 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1141  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.42 
 
 
220 aa  256  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115046  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.56 
 
 
211 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.4 
 
 
255 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2970  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.89 
 
 
220 aa  255  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.421723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.96 
 
 
221 aa  255  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.14 
 
 
222 aa  254  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.93 
 
 
268 aa  253  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1435  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  65.89 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4634  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.89 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.43 
 
 
234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.81 
 
 
222 aa  252  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  58.49 
 
 
218 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.28 
 
 
215 aa  251  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1459  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  65.42 
 
 
216 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.961201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1619  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.49 
 
 
218 aa  251  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5437  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  64.32 
 
 
215 aa  251  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.77 
 
 
229 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.77 
 
 
229 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2252  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.02 
 
 
218 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1403  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.77 
 
 
229 aa  250  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.6 
 
 
218 aa  250  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2503  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.79 
 
 
228 aa  250  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>