151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0116 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0116  membrane protein of unknown function  100 
 
 		 134 aa  250  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2723  membrane protein of unknown function  74.63 
 
 		 133 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.67205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1471  membrane protein of unknown function  64.1 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0712  membrane protein of unknown function  64.04 
 
 		 115 aa  140  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1137  membrane protein of unknown function  60.94 
 
 		 134 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.278732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1075  membrane protein of unknown function  60.15 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2917  membrane protein of unknown function  50.47 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0859  membrane protein of unknown function  42.86 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2051  membrane protein of unknown function  41.82 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2025  membrane protein of unknown function  41.82 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3164  hypothetical protein  46.15 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2841  hypothetical protein  46.15 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0056  YvlD  46.15 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3416  hypothetical protein  46.15 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1702  hypothetical protein  46.15 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3837  hypothetical protein  46.15 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3918  hypothetical protein  46.15 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3135  hypothetical protein  46.15 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0179  hypothetical protein  45.79 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0181  membrane protein of unknown function  45.19 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  normal  0.0333124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3757  membrane protein of unknown function  46.73 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3376  hypothetical protein  44.23 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2834  membrane protein of unknown function  44.23 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0187  membrane protein of unknown function  44.23 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0273  membrane protein of unknown function  44.23 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.896434  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0255  membrane protein of unknown function  44.23 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0200  membrane protein of unknown function  44.23 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0995  membrane protein of unknown function  48 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3391  membrane protein of unknown function  42.57 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2195  membrane protein of unknown function  41.51 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000942046  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1444  membrane protein of unknown function  46.79 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5175  membrane protein of unknown function  40.95 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0214  membrane protein of unknown function  45 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0611076  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1135  membrane protein of unknown function  63.64 
 
 		 66 aa  80.1  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708618 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1110  membrane protein of unknown function  46.15 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4668  membrane protein of unknown function  40.38 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0487  membrane protein of unknown function  30.65 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1203  membrane protein of unknown function  43.4 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3080  hypothetical protein  47.78 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2178  hypothetical protein  46.53 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.71562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5482  membrane protein of unknown function  41.75 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.296215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2988  membrane protein of unknown function  47.19 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.547777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2280  membrane protein of unknown function  41 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2245  membrane protein of unknown function  37.5 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0809  membrane protein of unknown function  41.96 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2963  hypothetical protein  35.2 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000675616  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4042  membrane protein of unknown function  42.39 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.700012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1666  membrane protein of unknown function  40.4 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.124642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4312  membrane protein of unknown function  40.35 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.753835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0092  hypothetical protein  42.27 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04360  hypothetical protein  46.91 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3918  membrane protein of unknown function  45.98 
 
 		 117 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.00320816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4241  membrane protein of unknown function  41 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3172  membrane protein of unknown function  46.07 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25510  predicted membrane protein  39.37 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.355716  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1495  hypothetical protein  42.73 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4653  membrane protein of unknown function  38.4 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330782  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11932  hypothetical protein  35.9 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4088  hypothetical protein  38.6 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0596  hypothetical protein  39.22 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2711  membrane protein of unknown function  36.21 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.233324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4884  membrane protein of unknown function  39.47 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0393  membrane protein of unknown function  42.86 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.785636  normal  0.196357 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35940  predicted membrane protein  34.65 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.334945  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1532  membrane protein of unknown function  37.7 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.679157 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1180  membrane protein of unknown function  46.36 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1873  hypothetical protein  42.39 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3678  membrane protein of unknown function  31.75 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1851  membrane protein of unknown function  37.61 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0493  membrane protein of unknown function  40.17 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2284  membrane protein  36 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2165  membrane protein of unknown function  47.52 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.44463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2118  membrane protein of unknown function  47.52 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1341  membrane protein of unknown function  40.78 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0664  membrane protein of unknown function  46.96 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3507  membrane protein of unknown function  45.74 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3970  membrane protein of unknown function  34.15 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4717  membrane protein of unknown function  35.09 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.559466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0378  membrane protein of unknown function  45.22 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4337  membrane protein of unknown function  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00733225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4423  membrane protein of unknown function  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.512548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3407  membrane protein of unknown function  38.68 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2907  membrane protein of unknown function  36.13 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0925  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0469  membrane protein of unknown function  35.64 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0977  membrane protein of unknown function  33.33 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3396  membrane protein of unknown function  37.74 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.573144  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2755  hypothetical protein  37.14 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0137  membrane protein of unknown function  35 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2213  hypothetical protein  34.13 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4413  membrane protein of unknown function  40.18 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2469  membrane protein of unknown function  34.62 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.978118  normal  0.0141689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6954  membrane protein of unknown function  42.86 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3225  membrane protein of unknown function  38.4 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0192  membrane protein of unknown function  39.53 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3555  membrane protein of unknown function  34.95 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0169629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0362  membrane protein of unknown function  34.43 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4516  membrane protein of unknown function  35.38 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3547  membrane protein of unknown function  37.86 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4032  membrane protein of unknown function  42.45 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>