39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1718 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  427  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  38.31 
 
 		 225 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  39.04 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  39.04 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  36.97 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  40.41 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  37.69 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  36.61 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  36.32 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  36.1 
 
 		 221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  35.82 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  35.75 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  33.65 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  32.68 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  34.81 
 
 		 189 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  34.81 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  34.81 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  32.87 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  32.47 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  29.95 
 
 		 208 aa  94.7  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  34.57 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  30.06 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  30.06 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1404  hypothetical protein  45.07 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  28.22 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  29.63 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  28.83 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  27.81 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  31.21 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0390.1  hypothetical protein  25.93 
 
 		 161 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  25.41 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  29.63 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  25.14 
 
 		 311 aa  45.1  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  23.33 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2917  hypothetical protein  28.74 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000650535  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  27.78 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  26.06 
 
 		 239 aa  42  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3439  hypothetical protein  36.11 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>