34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1691 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  54.46 
 
 
225 aa  236  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  53.05 
 
 
225 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  53.81 
 
 
215 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  36.65 
 
 
199 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  37.69 
 
 
206 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  32.42 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  31.65 
 
 
221 aa  118  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  34.92 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  32.99 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  34.44 
 
 
208 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  32.46 
 
 
208 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  34.18 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  31.47 
 
 
225 aa  99  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  32.14 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  32.6 
 
 
202 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  30.32 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  30.48 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  34.3 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  30.32 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  28.82 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  30.15 
 
 
208 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  26.64 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  30.87 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  27.31 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  28.34 
 
 
360 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1404  hypothetical protein  40.28 
 
 
72 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  25.39 
 
 
187 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  28.79 
 
 
198 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  23.68 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  27.8 
 
 
274 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  23.7 
 
 
311 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  28.97 
 
 
191 aa  42  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>