30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3328 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  46.12 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  43.75 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  41.04 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  41.21 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  40.7 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  38.78 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  40.93 
 
 		 189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  40.82 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  39.9 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  39.9 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  37.82 
 
 		 221 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  37.19 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  41.44 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  39.78 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  35.98 
 
 		 220 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  34.44 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  33.65 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  32.95 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  33.16 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  31.09 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  29.41 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  29.83 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  29.18 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  29.41 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  31.96 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1404  hypothetical protein  35.21 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  26.46 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  24.87 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  26.34 
 
 		 360 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>