18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0244 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  400  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0390.1  hypothetical protein  41.18 
 
 		 161 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  32.4 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1596  hypothetical protein  39.86 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0754953  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  30.69 
 
 		 360 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  33.82 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  31.87 
 
 		 272 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  32.39 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  27.17 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  26.71 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  26.11 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3439  hypothetical protein  25.74 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2917  hypothetical protein  25.74 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000650535  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  27.78 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  22.45 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  28.97 
 
 		 220 aa  42  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  23.86 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>