29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1781 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  41.88 
 
 
189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  43.23 
 
 
203 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  41.05 
 
 
189 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  40.53 
 
 
189 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  41.97 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  34.78 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  35.61 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  36.56 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  35.79 
 
 
199 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  35.75 
 
 
206 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  34.69 
 
 
208 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  35 
 
 
221 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  34.33 
 
 
222 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  33.16 
 
 
208 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  32.34 
 
 
243 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  34.03 
 
 
208 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  30.05 
 
 
225 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  35.56 
 
 
215 aa  99.4  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  34.92 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  31.49 
 
 
243 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  31.49 
 
 
243 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  35.91 
 
 
225 aa  92  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  36.42 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  34.54 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  27.84 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1404  hypothetical protein  29.58 
 
 
72 aa  48.9  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2917  hypothetical protein  25.74 
 
 
219 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000650535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>