21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2018 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  38 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  37.37 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  38.95 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  32.74 
 
 		 216 aa  85.9  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1596  hypothetical protein  34.01 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0754953  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  27.38 
 
 		 360 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  29.79 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0390.1  hypothetical protein  28.77 
 
 		 161 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  30.84 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  22.29 
 
 		 198 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  25.39 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  24.08 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  25.41 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  25.87 
 
 		 225 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  24.86 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  27.8 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  25.66 
 
 		 225 aa  42.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2274  hypothetical protein  22.73 
 
 		 187 aa  42.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000533455  normal  0.189783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>