26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0768 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  51.22 
 
 
203 aa  208  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  38.78 
 
 
208 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  41.92 
 
 
189 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  39.2 
 
 
207 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  41.92 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  38.5 
 
 
222 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  41.41 
 
 
189 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  36.67 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  38.24 
 
 
221 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  34.78 
 
 
198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  34.98 
 
 
220 aa  111  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  32.48 
 
 
243 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  32.05 
 
 
243 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  32.05 
 
 
243 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  32.05 
 
 
243 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  33.16 
 
 
208 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  34 
 
 
215 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  33.5 
 
 
199 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  32.87 
 
 
206 aa  99  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  33 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  33 
 
 
225 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527879 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  30.61 
 
 
208 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  30.92 
 
 
202 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  30.15 
 
 
220 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  29.13 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>