29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1077 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  97.88 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  96.83 
 
 		 189 aa  383  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  43.23 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  41.48 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  41.05 
 
 		 243 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  40.17 
 
 		 243 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  41.8 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  41.05 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  41.33 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  41.92 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  41.92 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  39.9 
 
 		 208 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  40 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  39.78 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  36.55 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  35.29 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  34.97 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  34.95 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  35.71 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  34.81 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  33.51 
 
 		 208 aa  95.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  30.32 
 
 		 220 aa  94.4  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  32.64 
 
 		 202 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  30.05 
 
 		 225 aa  81.3  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1404  hypothetical protein  36.62 
 
 		 72 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  27.68 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  24.1 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>