26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4793 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  508  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  94.24 
 
 		 243 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  93.42 
 
 		 243 aa  471  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  85.19 
 
 		 243 aa  427  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  41.74 
 
 		 189 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  41.48 
 
 		 189 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  41.05 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  34.19 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  32.05 
 
 		 208 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  33.04 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  32.02 
 
 		 209 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  39.86 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  32.34 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  30.34 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  31.2 
 
 		 215 aa  93.6  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  29.96 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  29.18 
 
 		 208 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  30.74 
 
 		 221 aa  88.6  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  30.74 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  29.06 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  33.77 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  30.87 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  30.06 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  30.38 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  31.88 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  27.81 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>