37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3513 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  100 
 
 		 222 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  67.87 
 
 		 221 aa  314  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  39.55 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  40.82 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  36.82 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  42.35 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  37.62 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  38.5 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  40.82 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  40.41 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  37.88 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  40.32 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  39.9 
 
 		 199 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  37.82 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  39.78 
 
 		 189 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371297 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  39.78 
 
 		 189 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  32.42 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  35.1 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  34.39 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  34.33 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  29.52 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  31.76 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  30.9 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  30.74 
 
 		 243 aa  88.2  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  30.74 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1404  hypothetical protein  39.44 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  24.54 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  25.26 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  24.19 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  28.81 
 
 		 360 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3439  hypothetical protein  27.66 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2917  hypothetical protein  26.95 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000650535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  27.42 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0390.1  hypothetical protein  23.53 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  22.45 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  25.11 
 
 		 311 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>