20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1404 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1404  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  149  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  45.07 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  44.29 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  44.29 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  42.86 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  41.54 
 
 		 225 aa  60.1  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  39.44 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  38.03 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  35.21 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  35.21 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  36.62 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  40.35 
 
 		 220 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  40.28 
 
 		 220 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  36.62 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  36.62 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  36.62 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  29.58 
 
 		 198 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  34.25 
 
 		 203 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  34.33 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  31.08 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>