35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1795 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  470  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  89.33 
 
 		 225 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  90.23 
 
 		 215 aa  407  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  54.46 
 
 		 220 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  41.21 
 
 		 208 aa  156  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  36.82 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  39.04 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  36.87 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  36.98 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  37.11 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  37.7 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  36.73 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  33.18 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  37.77 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  37.38 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  36.07 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  35.26 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  32.31 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  34.97 
 
 		 189 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  34.97 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  33.19 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  31.2 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  33 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  30.34 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  35.91 
 
 		 198 aa  92  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1404  hypothetical protein  44.29 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  28.4 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  29.95 
 
 		 272 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  26.67 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  24.76 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  26.26 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  24.86 
 
 		 274 aa  45.4  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  26.42 
 
 		 360 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  25.6 
 
 		 311 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>