28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0762 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  440  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  39.22 
 
 
203 aa  154  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  43.33 
 
 
207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  42.71 
 
 
189 aa  141  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  41.92 
 
 
189 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  41.71 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  36.67 
 
 
208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  37.88 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  38.68 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  41.44 
 
 
208 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  35.15 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  37.11 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  36.56 
 
 
198 aa  111  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  33.68 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  32.31 
 
 
225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  32.99 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  33.68 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  32.02 
 
 
243 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  32.68 
 
 
206 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  32.21 
 
 
199 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  30.88 
 
 
225 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  31.3 
 
 
243 aa  95.9  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  39.85 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  30.17 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  31.77 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  28.57 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  27.12 
 
 
187 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1404  hypothetical protein  31.08 
 
 
72 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>