31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1252 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1252  transposase  100 
 
 		 221 aa  466  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  67.87 
 
 		 222 aa  314  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  39.8 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  40.2 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  38.97 
 
 		 207 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  36.87 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  36.87 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  37.82 
 
 		 208 aa  128  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  40.54 
 
 		 189 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  40 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  40 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  38.24 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  36.08 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  36.54 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  36.46 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  36.1 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  31.65 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  32.63 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  35.15 
 
 		 209 aa  115  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  35.78 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  33.33 
 
 		 202 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  35 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  32.59 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  31.17 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  30.74 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  25.81 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1404  hypothetical protein  38.03 
 
 		 72 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  24.64 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  25 
 
 		 187 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  28.68 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>