31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2858 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0390.1  hypothetical protein  40.29 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  32.4 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  33.74 
 
 		 360 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  85.1  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  27.16 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  31.21 
 
 		 311 aa  72  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1596  hypothetical protein  28.97 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0754953  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  29.63 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  25.14 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  29.13 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  27.56 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  29.48 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  26.55 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  25.26 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  28.4 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  28.12 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  26.46 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  25 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  28.49 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  30.39 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3439  hypothetical protein  24.68 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  27.12 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2917  hypothetical protein  24.34 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000650535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  25.26 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  25.39 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0345  hypothetical protein  30.43 
 
 		 199 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23081  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  24.86 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  24.1 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  24.1 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  24.1 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>