14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0345 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0345  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2274  hypothetical protein  62.5 
 
 		 187 aa  250  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000533455  normal  0.189783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1305  hypothetical protein  63.95 
 
 		 175 aa  240  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.582103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2879  hypothetical protein  38.95 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3139  hypothetical protein  38.1 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4691  hypothetical protein  32.35 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4784  hypothetical protein  31.18 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1160  hypothetical protein  30.07 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763364  normal  0.412717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3695  hypothetical protein  25.93 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0185  hypothetical protein  28.24 
 
 		 402 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543863  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2353  hypothetical protein  36.36 
 
 		 296 aa  45.1  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225651 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  30.43 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2473  hypothetical protein  22.75 
 
 		 335 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1641  hypothetical protein  25.45 
 
 		 388 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>