15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1305 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1305  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.582103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2274  hypothetical protein  94.25 
 
 
187 aa  346  8e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000533455  normal  0.189783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0345  hypothetical protein  63.95 
 
 
199 aa  240  9e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2879  hypothetical protein  36.57 
 
 
193 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3139  hypothetical protein  41.29 
 
 
195 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4691  hypothetical protein  32.94 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4784  hypothetical protein  31.76 
 
 
188 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.349469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1160  hypothetical protein  24.07 
 
 
314 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763364  normal  0.412717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3695  hypothetical protein  23.9 
 
 
361 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2353  hypothetical protein  27.52 
 
 
296 aa  48.1  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225651 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1623  hypothetical protein  25.29 
 
 
304 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082001 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0185  hypothetical protein  27.61 
 
 
402 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543863  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2473  hypothetical protein  23.75 
 
 
335 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  22.52 
 
 
274 aa  41.2  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1641  hypothetical protein  25.45 
 
 
388 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>