12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1641 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1641  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  805    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0185  hypothetical protein  28.3 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543863  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1160  hypothetical protein  27.57 
 
 		 314 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763364  normal  0.412717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2473  hypothetical protein  25 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0679  hypothetical protein  36.57 
 
 		 214 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1623  hypothetical protein  29.78 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082001 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0860  hypothetical protein  27.23 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.182154  normal  0.631757 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3695  hypothetical protein  25.11 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3666  hypothetical protein  24.21 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2353  hypothetical protein  27.65 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225651 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2274  hypothetical protein  25.44 
 
 		 187 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000533455  normal  0.189783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0345  hypothetical protein  25.45 
 
 		 199 aa  42.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>