13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0185 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0185  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  839    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543863  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1641  hypothetical protein  28.3 
 
 
388 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2473  hypothetical protein  25.31 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1160  hypothetical protein  22.92 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763364  normal  0.412717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3695  hypothetical protein  24.78 
 
 
361 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0679  hypothetical protein  34.62 
 
 
214 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2879  hypothetical protein  31.5 
 
 
193 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1623  hypothetical protein  32.06 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082001 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2274  hypothetical protein  28.36 
 
 
187 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000533455  normal  0.189783 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2353  hypothetical protein  25.13 
 
 
296 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225651 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0345  hypothetical protein  28.24 
 
 
199 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23081  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1305  hypothetical protein  27.61 
 
 
175 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.582103 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3666  hypothetical protein  26.63 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>