16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2353 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2353  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  617  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225651 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1623  hypothetical protein  47.57 
 
 
304 aa  278  7e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082001 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0860  hypothetical protein  38.84 
 
 
229 aa  179  7e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.182154  normal  0.631757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2473  hypothetical protein  32.4 
 
 
335 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1160  hypothetical protein  28.22 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763364  normal  0.412717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1641  hypothetical protein  27.65 
 
 
388 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0185  hypothetical protein  25.13 
 
 
402 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3695  hypothetical protein  30.07 
 
 
361 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3139  hypothetical protein  28.07 
 
 
195 aa  49.3  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2274  hypothetical protein  26.61 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000533455  normal  0.189783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1305  hypothetical protein  27.52 
 
 
175 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.582103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2879  hypothetical protein  31.09 
 
 
193 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0345  hypothetical protein  36.36 
 
 
199 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4784  hypothetical protein  21.88 
 
 
188 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.349469 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3666  hypothetical protein  30.3 
 
 
413 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4691  hypothetical protein  21.25 
 
 
188 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>