15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2473 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2473  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  704    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1160  hypothetical protein  51.14 
 
 
314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763364  normal  0.412717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1641  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0185  hypothetical protein  25.31 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543863  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2353  hypothetical protein  32.4 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225651 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1623  hypothetical protein  32.46 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082001 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3695  hypothetical protein  29.67 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3666  hypothetical protein  34.11 
 
 
413 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4691  hypothetical protein  25.75 
 
 
188 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0860  hypothetical protein  25.63 
 
 
229 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.182154  normal  0.631757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0679  hypothetical protein  35.78 
 
 
214 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4784  hypothetical protein  23.95 
 
 
188 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.349469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1305  hypothetical protein  23.75 
 
 
175 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.582103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2879  hypothetical protein  26.4 
 
 
193 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0345  hypothetical protein  22.75 
 
 
199 aa  43.1  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>