13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3666 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3666  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  866    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2473  hypothetical protein  34.11 
 
 		 335 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1160  hypothetical protein  23.44 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763364  normal  0.412717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1641  hypothetical protein  24.21 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3695  hypothetical protein  23.45 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4784  hypothetical protein  28.89 
 
 		 188 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349469 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4691  hypothetical protein  28.15 
 
 		 188 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0860  hypothetical protein  22.45 
 
 		 229 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.182154  normal  0.631757 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1623  hypothetical protein  23.19 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082001 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0185  hypothetical protein  26.63 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543863  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2274  hypothetical protein  27.82 
 
 		 187 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000533455  normal  0.189783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0679  hypothetical protein  26.47 
 
 		 214 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2353  hypothetical protein  30.3 
 
 		 296 aa  43.5  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>