17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1160 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1160  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  648    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763364  normal  0.412717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2473  hypothetical protein  51.14 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1641  hypothetical protein  25.91 
 
 		 388 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1623  hypothetical protein  34.88 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082001 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0185  hypothetical protein  24.51 
 
 		 402 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543863  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2353  hypothetical protein  28.4 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225651 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0345  hypothetical protein  30.07 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23081  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4691  hypothetical protein  28.03 
 
 		 188 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0860  hypothetical protein  25.82 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.182154  normal  0.631757 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4784  hypothetical protein  27.22 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.349469 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3666  hypothetical protein  23.44 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3695  hypothetical protein  24.09 
 
 		 361 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2879  hypothetical protein  29.68 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2274  hypothetical protein  24.07 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000533455  normal  0.189783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0679  hypothetical protein  31.75 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1305  hypothetical protein  25.81 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.582103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3139  hypothetical protein  26.45 
 
 		 195 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>