17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2681 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  27.16 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  29.79 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  35.38 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  29.11 
 
 		 360 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0390.1  hypothetical protein  29.53 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  33.85 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1596  hypothetical protein  28.67 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0754953  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  26.67 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  26.71 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  26.67 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  26.67 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  30.97 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  30.63 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  23.68 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  32 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  28.68 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>