23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3782 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  568  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  71 
 
 		 239 aa  345  4e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  48.09 
 
 		 311 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  38 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0390.1  hypothetical protein  30.77 
 
 		 161 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  31.87 
 
 		 191 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1596  hypothetical protein  33.78 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0754953  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  29.58 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  29.13 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  28.38 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3439  hypothetical protein  35.58 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  28.8 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2917  hypothetical protein  34.31 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000650535  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  24.64 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  24.19 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2681  hypothetical protein  26.67 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0631191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  27.55 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  29.95 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  26.4 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  30.77 
 
 		 220 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  23.5 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  23.33 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  25.27 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>