31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2954 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  470  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  40 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1767  hypothetical protein  34.6 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.834919  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  38.59 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  35.38 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  33.18 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  35.78 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  34.83 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  32.21 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  35.1 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  30.81 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  30.05 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0762  hypothetical protein  30.88 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  31.09 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  31.47 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001841  hypothetical protein  29.63 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  31.02 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  30.57 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0768  hypothetical protein  29.13 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  30.05 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  30.05 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1404  hypothetical protein  41.54 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3198  hypothetical protein  26 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4793  hypothetical protein  27.81 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4689  hypothetical protein  26.67 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3395  hypothetical protein  27.01 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  25.27 
 
 		 272 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  27.95 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  25.66 
 
 		 274 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  24.4 
 
 		 198 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>