30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2576 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  417  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2917  hypothetical protein  39.56 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000650535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3439  hypothetical protein  39.67 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1252  transposase  25.81 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0590866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0390.1  hypothetical protein  28.49 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  27.81 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  28.8 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  27.17 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  25.91 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  24.54 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  26.55 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  35.05 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1781  hypothetical protein  27.84 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  31.71 
 
 		 311 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2018  hypothetical protein  22.29 
 
 		 274 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0453022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1077  hypothetical protein  27.68 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371297 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0924  CP4-57 prophage; hypothetical protein  33.04 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00353678  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  33.33 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1393  hypothetical protein  25.41 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3328  conserved hypothetical protein  24.87 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1795  hypothetical protein  26.26 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1691  hypothetical protein  28.79 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.669152  normal  0.0131233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2132  hypothetical protein  27.38 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4754  transposase  30.56 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  31.4 
 
 		 360 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1049  conserved hypothetical protein  23.95 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1596  hypothetical protein  26.22 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0754953  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2954  hypothetical protein  24.4 
 
 		 225 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1443  hypothetical protein  24.73 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4884  hypothetical protein  26.47 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>