46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0509 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  100 
 
 		 106 aa  216  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2098  putative anti-sigma B factor antagonist  55 
 
 		 109 aa  114  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  56.04 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002413  putative anti-sigma B factor antagonist  56.32 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0382  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.9374  normal  0.215412 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  32.53 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0557  anti-sigma-factor antagonist  33.72 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.102559  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  32.53 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  32.53 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  32.53 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  32.53 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  32.22 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  35.71 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4532  STAS domain-containing protein  30.95 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  28.87 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  30.34 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  31.25 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  28.92 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  32.18 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  28.92 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  28.92 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  32.14 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4777  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00603517  hitchhiker  0.00801685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1918  anti-sigma-factor antagonist  28.92 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1966  STAS domain-containing protein  29.03 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  25.64 
 
 		 380 aa  43.5  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  32.18 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  31.11 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5024  hypothetical protein  27.66 
 
 		 102 aa  42  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0516  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000230981  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03056  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03007  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0176989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0471  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 120 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00988083  hitchhiker  0.0000661434 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4513  YrbB  36.36 
 
 		 97 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0162677  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3385  YrbB  36.36 
 
 		 97 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000270552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3678  YrbB  36.36 
 
 		 97 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.002943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3487  YrbB  36.36 
 
 		 97 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0509  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.784342  normal  0.1655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57830  hypothetical protein  28.42 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  29.11 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2416  anti-sigma-factor antagonist  26.47 
 
 		 112 aa  40  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.015086 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3579  YrbB  36.36 
 
 		 97 aa  40  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0908336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>