51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04790 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04790  integrase  100 
 
 		 274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0127  hypothetical protein, putative phage gene  48.31 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1533  hypothetical protein  47.37 
 
 		 104 aa  83.2  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.65333  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  36.46 
 
 		 187 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  43.24 
 
 		 186 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  43.21 
 
 		 186 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.51 
 
 		 180 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  26.48 
 
 		 189 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22.92 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  32.91 
 
 		 180 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.97 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  24.62 
 
 		 189 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  31.91 
 
 		 180 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  33.33 
 
 		 180 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  32.91 
 
 		 180 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  32.91 
 
 		 180 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  29.06 
 
 		 180 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  40.85 
 
 		 186 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  40.32 
 
 		 190 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  32.1 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  34.29 
 
 		 73 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2102  integrase family protein  36.47 
 
 		 193 aa  45.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0337  Integrase  39.58 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  37.14 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  37.14 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  26.67 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  32.56 
 
 		 188 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1145  putative transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 		 408 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.239655 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  31.78 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  28.79 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  37.14 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  38.57 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  36.67 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  31.78 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  36.67 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  36.67 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  47.83 
 
 		 204 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  36.67 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  33.77 
 
 		 188 aa  43.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  45.65 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  36.67 
 
 		 188 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  39.58 
 
 		 215 aa  43.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  30.34 
 
 		 180 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  26.52 
 
 		 188 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0195  phage integrase family protein  29.59 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0644  phage integrase family protein  35.21 
 
 		 186 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0659  phage integrase family protein  35.21 
 
 		 186 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.271524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  27.97 
 
 		 409 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  31.86 
 
 		 186 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  29.33 
 
 		 195 aa  42.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  41.67 
 
 		 188 aa  42  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>