More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02846 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  349  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  76.82 
 
 
152 aa  258  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  46.47 
 
 
178 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  42.94 
 
 
175 aa  166  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.94 
 
 
188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  41.1 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.88 
 
 
174 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.62 
 
 
174 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.62 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  41.29 
 
 
182 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.77 
 
 
177 aa  134  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  34.5 
 
 
184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  35.12 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  33.93 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  35.1 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  31.1 
 
 
223 aa  105  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  31.14 
 
 
183 aa  104  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  29.88 
 
 
184 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  29.63 
 
 
169 aa  98.2  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  34.97 
 
 
168 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  34.36 
 
 
168 aa  97.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.8 
 
 
183 aa  97.4  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  29.95 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.34 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  35.51 
 
 
165 aa  95.5  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  33.95 
 
 
168 aa  94  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  27.11 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  33.54 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  33.33 
 
 
168 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  33.33 
 
 
168 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.15 
 
 
179 aa  85.1  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.64 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  25.15 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  25 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.54 
 
 
210 aa  61.6  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  26.03 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  26.61 
 
 
162 aa  58.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  31.48 
 
 
167 aa  57.8  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.61 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.1 
 
 
422 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  30.69 
 
 
259 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  26 
 
 
403 aa  52  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0085  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  30 
 
 
170 aa  51.6  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  28.15 
 
 
144 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  25 
 
 
403 aa  51.2  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  31.2 
 
 
171 aa  50.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.51 
 
 
171 aa  50.8  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1155  redoxin  26.4 
 
 
137 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  30.91 
 
 
107 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.72 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  26.09 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.9 
 
 
409 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  30.91 
 
 
107 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  29.69 
 
 
278 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  31.78 
 
 
106 aa  49.7  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  25.81 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  29.2 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  29.7 
 
 
259 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  25.81 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2143  Thioredoxin domain protein  43.18 
 
 
108 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.61 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0354  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.1 
 
 
191 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  31.11 
 
 
437 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0367  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.1 
 
 
191 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.17 
 
 
433 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1539  redoxin domain-containing protein  29.17 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482949  normal  0.281635 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  27.08 
 
 
266 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.07 
 
 
169 aa  48.5  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0365  periplasmic protein thiol  25.38 
 
 
197 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0413  periplasmic protein thiol  24.28 
 
 
197 aa  48.5  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  28.91 
 
 
278 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  25 
 
 
184 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  25 
 
 
184 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  25 
 
 
184 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  25 
 
 
184 aa  48.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  25 
 
 
184 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  25 
 
 
184 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  25 
 
 
184 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  27.73 
 
 
174 aa  47.8  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  26.72 
 
 
170 aa  47.8  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0340  hypothetical protein  28.19 
 
 
192 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  25.81 
 
 
209 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  30.91 
 
 
107 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  25 
 
 
184 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  28.71 
 
 
257 aa  47.4  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2277  Thioredoxin domain protein  32 
 
 
149 aa  47.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00669131  hitchhiker  0.000000625569 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  37.35 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  23.77 
 
 
105 aa  47  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  30.1 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1829  peroxiredoxin-like  22.81 
 
 
167 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000091081  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.91 
 
 
169 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  28.45 
 
 
105 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1410  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  28.4 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459055  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.5 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.09 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2788  putative thiol:disulfide interchange protein  25.55 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1860  cytochrome c biogenesis protein, thiol-disulfide interchange protein  23.7 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  26.8 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0470  putative thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 
266 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>