49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00664 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00664  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  100 
 
 
238 aa  495  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001809  3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase  71.98 
 
 
236 aa  345  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0182  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  63.79 
 
 
234 aa  305  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0241  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  63.79 
 
 
234 aa  305  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.97 
 
 
251 aa  299  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.53 
 
 
239 aa  208  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0117  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.95 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00060  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.83 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0330  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.31 
 
 
231 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0068  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  45.07 
 
 
252 aa  176  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000292755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3612  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.39 
 
 
249 aa  175  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3897  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.08 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0105  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.86 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3706  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.86 
 
 
241 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0043809  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4677  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.18 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.66 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1694  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  42.08 
 
 
236 aa  165  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3898  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.93 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.217964  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3989  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.08 
 
 
250 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4477  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.52 
 
 
251 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.621367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.08 
 
 
250 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.238645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0061  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.45 
 
 
251 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0783873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4282  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.11 
 
 
251 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676386 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3935  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.28 
 
 
242 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0314402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4337  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.45 
 
 
251 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  40.72 
 
 
250 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.0000139094 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1292  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  36.32 
 
 
249 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1357  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  36.32 
 
 
249 aa  148  8e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0850  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  34.75 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0015  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  31.69 
 
 
239 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02451  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  34.8 
 
 
249 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2807  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.13 
 
 
256 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.7235 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2259  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.44 
 
 
244 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0778  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.82 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0306  lipopolysaccharide kinase  38.42 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1796  hypothetical protein  28.33 
 
 
782 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1268  hypothetical protein  24.87 
 
 
466 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7753  Serine/threonine protein kinase-like protein  28.85 
 
 
512 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  34.74 
 
 
583 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02913  RIO1//family protein  25 
 
 
286 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  33.68 
 
 
586 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0453  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  24.59 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1269  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  21.58 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  30 
 
 
518 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0316  lipopolysaccharide kinase  27.41 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0739  protein of unknown function RIO1  26.32 
 
 
301 aa  42.7  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000129617  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01260  SNF1 family protein kinase, putative  25.56 
 
 
596 aa  42.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  33.33 
 
 
509 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  23.48 
 
 
324 aa  42  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>