46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00355 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00355  NADH dehydrogenase  100 
 
 		 151 aa  301  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002082  membrane protein  87.42 
 
 		 151 aa  279  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0941  DoxX family protein  70.21 
 
 		 145 aa  203  8e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0809  DoxD family protein  51.66 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3395  DoxD family protein  48.82 
 
 		 156 aa  124  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0722  hypothetical protein  49.61 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0702  hypothetical protein  49.61 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2361  DoxX family protein  42.18 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2690  DoxX  43.55 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.360255  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  41.94 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2957  hypothetical protein  50.45 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02374  hypothetical protein  41.18 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.861023  normal  0.0466865 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4399  DoxX family protein  40.77 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4289  DoxX family protein  40.77 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2679  DoxX  39.22 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3128  DoxX family protein  33.77 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0301  DoxX family protein  35.97 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1605  DoxX  34.75 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0755  DoxX family protein  34.81 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4682  thiosulphate:quinone oxidoreductase (TQO) small subunit(DoxD domain)  42.34 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.864959 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0707  hypothetical protein  32.03 
 
 		 738 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0727  hypothetical protein  32.45 
 
 		 738 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.65 
 
 		 730 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0098  DoxD family protein/pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.65 
 
 		 752 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1240  DoxX  32.62 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2032  hypothetical protein  33.14 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6307  DoxX family protein  39.2 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188963  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2030  DoxX family protein  40.82 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3394  hypothetical protein  31.65 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1002  hypothetical protein  35.71 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2188  DoxX family protein  38.82 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.62019  normal  0.793728 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5936  DoxX family protein  32.06 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1432  DoxX family protein  33.85 
 
 		 175 aa  53.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0990  DoxX family protein  39.53 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1027  DoxX family protein  36.67 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0584  hypothetical protein  29.92 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399737  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4649  DoxX  33.08 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5146  DoxX family protein  32.09 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3068  DoxX family protein  37.67 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00512546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  31.34 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  28.48 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0428  hypothetical protein  33.68 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  38.46 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  30.07 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  28.89 
 
 		 146 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3035  DoxX family protein  29.77 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.156785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>