46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004305 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  100 
 
 		 413 aa  859    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0336  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.44 
 
 		 394 aa  264  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2515  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  39.07 
 
 		 395 aa  233  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.991601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4043  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.5 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.07 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2512  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.47 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731479 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0203  hypothetical protein  34.58 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4040  hypothetical protein  31.53 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0333  hypothetical protein  31.66 
 
 		 387 aa  87.4  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1600  PfkB family carbohydrate kinase  30.05 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.744108 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.5 
 
 		 142 aa  62.4  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  35.38 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3641  pfkB family carbohydrate kinase  34.45 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2000  hypothetical protein  37.61 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5342  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  27.27 
 
 		 143 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.63 
 
 		 142 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  34.43 
 
 		 147 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1703  hypothetical protein  30.89 
 
 		 155 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0242104  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2452  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  33.91 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0433  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase superfamily protein  30.83 
 
 		 182 aa  52.4  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485819  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  31.61 
 
 		 306 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0656  hypothetical protein  31.67 
 
 		 156 aa  50.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  35.11 
 
 		 316 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  30 
 
 		 147 aa  49.7  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  36.99 
 
 		 315 aa  49.7  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  32.82 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  34.35 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0878  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  37.76 
 
 		 144 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.2 
 
 		 293 aa  47  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2574  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.27 
 
 		 156 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000346796  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  33.91 
 
 		 329 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  28.68 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  27.48 
 
 		 345 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  30.17 
 
 		 145 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  41.25 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3279  PfkB domain protein  30.43 
 
 		 321 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  38.71 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  33.91 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  26.45 
 
 		 161 aa  44.3  0.005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0101154  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0992  hypothetical protein  27.52 
 
 		 154 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.416112  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2470  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.48 
 
 		 279 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  35.29 
 
 		 327 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  34.04 
 
 		 314 aa  43.1  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  33.67 
 
 		 323 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  32.17 
 
 		 327 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10671  hypothetical protein  29.36 
 
 		 152 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>