More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003686 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003686  vitamin B12 ABC transporter ATPase component BtuD  100 
 
 		 254 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02133  vitamin B12-transporter ATPase  82.28 
 
 		 255 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0865  vitamin B12-transporter ATPase  54.33 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.232587  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1627  ABC transporter related  41.27 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1831  vitamin B12-transporter ATPase  40.87 
 
 		 245 aa  185  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2003  vitamin B12-transporter ATPase  40.87 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1470  vitamin B12-transporter ATPase  40.87 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1453  vitamin B12-transporter ATPase  40.87 
 
 		 245 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1437  vitamin B12-transporter ATPase  40.87 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0281162 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01678  vitamin B12-transporter ATPase  39.29 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0384865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1913  vitamin B12-transporter ATPase  39.13 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01667  hypothetical protein  39.29 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0246388  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2427  vitamin B12-transporter ATPase  39.29 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.516886  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1933  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0971316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1928  vitamin B12-transporter ATPase  39.29 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000867694  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1789  vitamin B12-transporter ATPase  39.29 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1922  vitamin B12-transporter ATPase  39.29 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1481  vitamin B12-transporter ATPase  39.29 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2153  vitamin B12-transporter ATPase  39.29 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2467  vitamin B12-transporter ATPase  39.68 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2773  vitamin B12-transporter ATPase  40.91 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1830  vitamin B12-transporter ATPase  40.24 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1722  vitamin B12-transporter ATPase  40.24 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.630088  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2614  vitamin B12-transporter ATPase  42.37 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1733  vitamin B12-transporter ATPase  40.33 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1656  ABC transporter related  39.5 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  35.92 
 
 		 264 aa  128  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  34.44 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  34.44 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  33.93 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  31.4 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  32.6 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02204  vitamin B12-transporter ATPase  30.8 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  34.35 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  34.15 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  31.82 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  31.98 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  32.48 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  33.77 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  32.27 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  34.66 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  33.86 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01538  ABC-type hemin transport system, ATPase component  32.64 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.554253  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  33.93 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.84 
 
 		 258 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  32.27 
 
 		 268 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  30.64 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  32.27 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  34.75 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  29.11 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  36.68 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  30.12 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  31.3 
 
 		 418 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  33.48 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  32.64 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  36.68 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  32.42 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  30.08 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  31.98 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  34.93 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  31.47 
 
 		 536 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1189  ABC transporter related  30.99 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  33.47 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  34.35 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  32.44 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  32.44 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  32.44 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  30.21 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  34.87 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.47 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  33.88 
 
 		 281 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.08 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  32.59 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  30.62 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  30.62 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  30.62 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.46 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  32.91 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1603  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.85 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2731  ABC transporter related  32.65 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  31.13 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  30.86 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  30.71 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0751  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  33.91 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  31.3 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5319  hemin importer ATP-binding subunit  31.01 
 
 		 276 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  31.3 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  30.68 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0852  ABC-transporter ATP-binding protein  31.94 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556343  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0770  ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.28039  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0695  ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  32.33 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  31.14 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1239  ABC-transporter ATP-binding protein  31.94 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  29.03 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1330  ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1788  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.85 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.193205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  31.25 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>