More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003568 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  63.42 
 
 
639 aa  781    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003568  ferrichrome transport system permease protein FhuB  100 
 
 
658 aa  1276    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1049  iron-hydroxamate transporter permease subunit  50.76 
 
 
669 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3460  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.7 
 
 
665 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3331  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.7 
 
 
670 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0996  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.7 
 
 
665 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0152  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40 
 
 
662 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1171  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.1 
 
 
672 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6476  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.33 
 
 
656 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.06 
 
 
672 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3976  iron-hydroxamate transporter permease subunit  40.9 
 
 
662 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6721  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.11 
 
 
665 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103992  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2783  iron-hydroxamate transporter permease subunit  42.23 
 
 
657 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.65 
 
 
694 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0227  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.09 
 
 
685 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3579  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.21 
 
 
659 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.205233  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0212  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.56 
 
 
685 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.800681  normal  0.940729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0223  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.93 
 
 
685 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0211  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.77 
 
 
685 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0230  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.77 
 
 
685 aa  364  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0693  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.52 
 
 
660 aa  362  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00152  fused iron-hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components  38.5 
 
 
660 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000693779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00151  hypothetical protein  38.5 
 
 
660 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000492106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0163  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.5 
 
 
660 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0157  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.5 
 
 
660 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0165  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.94 
 
 
660 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0158  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.6 
 
 
660 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3506  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.44 
 
 
660 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000390968  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3449  transport system permease protein  38.18 
 
 
660 aa  355  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.307809  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3107  iron-hydroxamate transporter permease subunit  37.86 
 
 
676 aa  354  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4801  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.07 
 
 
655 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0145  iron-hydroxamate transporter permease subunit  38.18 
 
 
660 aa  350  5e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2190  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.57 
 
 
677 aa  338  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.824441  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0906  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.03 
 
 
671 aa  336  7.999999999999999e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50350  iron-hydroxamate transporter permease subunit  43.79 
 
 
668 aa  325  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1304  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.34 
 
 
670 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001281  ferrichrome transport system permease protein FhuB  33.74 
 
 
655 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0087  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.68 
 
 
658 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2778  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.04 
 
 
665 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1438  iron-hydroxamate transporter permease subunit  39.68 
 
 
658 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.75 
 
 
678 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.75 
 
 
678 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.54 
 
 
678 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.7 
 
 
678 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.7 
 
 
678 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.7 
 
 
678 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.39 
 
 
678 aa  300  7e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.58 
 
 
644 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06297  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.91 
 
 
664 aa  296  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2583  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.39 
 
 
653 aa  295  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1141  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.54 
 
 
656 aa  268  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1910  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.19 
 
 
704 aa  241  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.620246  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3866  transport system permease protein  31.25 
 
 
700 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.14 
 
 
709 aa  237  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119028  normal  0.926797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3768  iron-hydroxamate transporter permease subunit  34.8 
 
 
658 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.150372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4067  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.61 
 
 
702 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.696001 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4043  iron-hydroxamate transporter permease subunit  28.21 
 
 
708 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0521  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.45 
 
 
704 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0296  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.69 
 
 
677 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4782  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.66 
 
 
696 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144873  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1533  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.3 
 
 
697 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1554  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.98 
 
 
697 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554327  normal  0.61391 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30490  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  31.71 
 
 
708 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161488  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1636  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.67 
 
 
696 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0420527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1156  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.67 
 
 
696 aa  180  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1611  iron-hydroxamate transporter permease subunit  30.27 
 
 
696 aa  177  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.531129  normal  0.0976725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2463  transport system permease protein  32.92 
 
 
700 aa  174  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3007  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.5 
 
 
710 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000466246 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2423  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.75 
 
 
659 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.204382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1602  iron-hydroxamate transporter permease subunit  28.82 
 
 
696 aa  163  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00028536 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1921  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.12 
 
 
706 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403612  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2081  iron-hydroxamate transporter permease subunit  28.96 
 
 
706 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.240812  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1935  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.12 
 
 
706 aa  151  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.293226  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 
338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1187  iron-hydroxamate transporter permease subunit  28.96 
 
 
706 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.704713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 
338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 
338 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1630  iron-hydroxamate transporter permease subunit  28.96 
 
 
706 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0779963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0293  iron-hydroxamate transporter permease subunit  28.96 
 
 
706 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00292434  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0868  iron-hydroxamate transporter permease subunit  28.96 
 
 
706 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315628  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3054  transport system permease protein  30.71 
 
 
708 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 
338 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  34.03 
 
 
338 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  34.03 
 
 
338 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  34.03 
 
 
338 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  34.03 
 
 
338 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 
338 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0692  transport system permease protein  32.42 
 
 
333 aa  148  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  31.93 
 
 
373 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  33.97 
 
 
322 aa  144  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  33.97 
 
 
322 aa  144  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  34.03 
 
 
326 aa  143  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  34.03 
 
 
338 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  33.68 
 
 
338 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 
321 aa  140  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  36.04 
 
 
350 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  33.45 
 
 
345 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0134  transport system permease protein  35.62 
 
 
338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  33.1 
 
 
342 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  34.67 
 
 
340 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>