More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000680 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3719  elongation factor G  47.16 
 
 		 700 aa  640    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252538 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3749  elongation factor G  48.66 
 
 		 688 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.158222  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2663  elongation factor G  46.13 
 
 		 682 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  49.93 
 
 		 680 aa  657    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000680  translation elongation factor G-related protein  100 
 
 		 674 aa  1387    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6425  elongation factor G  48.3 
 
 		 681 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1118  elongation factor G  47.01 
 
 		 682 aa  657    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1266  elongation factor G  45.82 
 
 		 684 aa  631  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.782059  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3402  elongation factor G  46.53 
 
 		 730 aa  628  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1382  elongation factor G  46.64 
 
 		 684 aa  627  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3200  elongation factor G  46.04 
 
 		 682 aa  628  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4182  elongation factor G  47.6 
 
 		 686 aa  616  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5542  elongation factor G  47.17 
 
 		 686 aa  612  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0222  elongation factor G  44.84 
 
 		 683 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  33.77 
 
 		 688 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  33.97 
 
 		 695 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  34.84 
 
 		 692 aa  435  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  33.63 
 
 		 696 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  33.14 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  33.33 
 
 		 697 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  34.4 
 
 		 683 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  33.05 
 
 		 703 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  34.15 
 
 		 701 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  34.15 
 
 		 703 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  34.25 
 
 		 701 aa  405  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  32.89 
 
 		 685 aa  403  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  34.07 
 
 		 692 aa  401  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  33.19 
 
 		 691 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  33.14 
 
 		 691 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  33.53 
 
 		 690 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  33.53 
 
 		 690 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  31.84 
 
 		 691 aa  395  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  34.1 
 
 		 692 aa  394  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  34.17 
 
 		 686 aa  392  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  34.69 
 
 		 683 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0933  elongation factor G  31.47 
 
 		 719 aa  390  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  33.73 
 
 		 673 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  33.83 
 
 		 696 aa  390  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  31.8 
 
 		 698 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  33.73 
 
 		 656 aa  392  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  33.57 
 
 		 692 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  31.54 
 
 		 693 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.68 
 
 		 682 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  31.66 
 
 		 698 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  31.2 
 
 		 695 aa  392  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  32.56 
 
 		 693 aa  391  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  33.14 
 
 		 691 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  32.3 
 
 		 679 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  33.48 
 
 		 689 aa  389  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  32.17 
 
 		 691 aa  389  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  31.95 
 
 		 698 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  33.48 
 
 		 691 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  32.85 
 
 		 680 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  31.71 
 
 		 685 aa  386  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  31.95 
 
 		 698 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  31.51 
 
 		 698 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  31.51 
 
 		 698 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  31.95 
 
 		 698 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  31.95 
 
 		 698 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  32.89 
 
 		 682 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  32.66 
 
 		 701 aa  388  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  32.75 
 
 		 691 aa  387  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  30.68 
 
 		 683 aa  388  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  31.63 
 
 		 691 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  33.33 
 
 		 695 aa  383  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0930  elongation factor G  33.33 
 
 		 697 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000763506  hitchhiker  0.00992492 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  32.54 
 
 		 690 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  31.82 
 
 		 707 aa  385  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  31.56 
 
 		 698 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  32.27 
 
 		 691 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  32.7 
 
 		 673 aa  382  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  33.38 
 
 		 691 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  31.17 
 
 		 690 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  32.38 
 
 		 701 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0292  translation elongation factor G  32.2 
 
 		 700 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000300154  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  32.8 
 
 		 691 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  33.38 
 
 		 691 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  31.2 
 
 		 697 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  30.44 
 
 		 694 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  32.59 
 
 		 696 aa  382  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  31.22 
 
 		 698 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  32.57 
 
 		 691 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  31.09 
 
 		 698 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  32.35 
 
 		 693 aa  381  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  32.86 
 
 		 691 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  32.61 
 
 		 691 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2409  elongation factor G  32.86 
 
 		 696 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000720128  hitchhiker  0.00000820155 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  32.34 
 
 		 697 aa  379  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  32.05 
 
 		 687 aa  379  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  31.56 
 
 		 692 aa  379  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  30.91 
 
 		 699 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  31.75 
 
 		 704 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0627  elongation factor G  33.29 
 
 		 694 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00051334  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  31.84 
 
 		 691 aa  379  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  31.74 
 
 		 690 aa  378  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  31.22 
 
 		 683 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1872  elongation factor G  32.67 
 
 		 694 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000621272  hitchhiker  0.00111051 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0357  elongation factor G  32.47 
 
 		 698 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.931415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  29.55 
 
 		 695 aa  374  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  31.7 
 
 		 691 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>