More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0237 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0237  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
110 aa  214  2.9999999999999998e-55  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  53.27 
 
 
103 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  53.27 
 
 
103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 
103 aa  110  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  52.34 
 
 
103 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  53.77 
 
 
105 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  53.27 
 
 
102 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 
105 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  50.93 
 
 
104 aa  101  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  50.93 
 
 
104 aa  101  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 
104 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
106 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
102 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 
106 aa  100  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 
104 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  100  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 
105 aa  100  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  51.85 
 
 
104 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  51.4 
 
 
102 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 
105 aa  98.2  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 
103 aa  97.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
105 aa  96.7  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
103 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
103 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 
105 aa  94.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
106 aa  94  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 
103 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 
107 aa  93.2  9e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
104 aa  93.6  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  49.06 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  49.06 
 
 
105 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  47.17 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  51.04 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 
105 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 
105 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  51.92 
 
 
112 aa  89.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  47.17 
 
 
105 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  38.83 
 
 
110 aa  88.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  49.04 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  48.57 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  46.15 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  45.79 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  43.93 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  45.37 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  42.99 
 
 
108 aa  84  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  46.15 
 
 
107 aa  83.6  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 
115 aa  83.6  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  48.57 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  50 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  44.23 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  47 
 
 
101 aa  82  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  46.46 
 
 
104 aa  82  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
105 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  43.93 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  42.99 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  47 
 
 
101 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  40.37 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  44.76 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  42.86 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  40.57 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  39.25 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  47.12 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 
108 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  43.69 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  44 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  43.93 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  47 
 
 
101 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  44 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  42.86 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  46 
 
 
101 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2158  ribosomal protein L24  45.37 
 
 
104 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0775088  normal  0.23262 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  46 
 
 
101 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2648  ribosomal protein L24  41.38 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  44 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  40.2 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  42.31 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  42.72 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>