More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0125 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0197  CTP synthetase  71.54 
 
 
525 aa  798    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000237577  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1012  CTP synthetase  68.29 
 
 
527 aa  731    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0111787  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0784  CTP synthetase  72.61 
 
 
525 aa  802    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0123  CTP synthetase  99.81 
 
 
524 aa  1061    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000806714  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0125  CTP synthetase  100 
 
 
524 aa  1062    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107739  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  51.89 
 
 
533 aa  519  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  48.58 
 
 
533 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  49.62 
 
 
563 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  47.66 
 
 
533 aa  505  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  50.37 
 
 
541 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0134  CTP synthetase  50.47 
 
 
541 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  51.12 
 
 
535 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1754  CTP synthetase  49.81 
 
 
546 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  48.51 
 
 
542 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  48.51 
 
 
542 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  48.51 
 
 
542 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  49.81 
 
 
555 aa  503  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  48.68 
 
 
542 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  49.81 
 
 
545 aa  498  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  50.67 
 
 
534 aa  501  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  50 
 
 
547 aa  501  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  48.71 
 
 
542 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  49.44 
 
 
555 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  48.32 
 
 
542 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  48 
 
 
538 aa  500  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  49.53 
 
 
533 aa  498  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1183  CTP synthase  50.28 
 
 
535 aa  495  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0724747  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  49.16 
 
 
531 aa  495  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  47.95 
 
 
543 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  50.1 
 
 
534 aa  495  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  48.5 
 
 
543 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  48.95 
 
 
535 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  48.95 
 
 
535 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  48.67 
 
 
530 aa  495  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  47.92 
 
 
534 aa  495  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  49.43 
 
 
537 aa  492  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  49.62 
 
 
536 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0228  CTP synthetase  49.81 
 
 
531 aa  494  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  47.34 
 
 
559 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0012  CTP synthetase  48.99 
 
 
545 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  48.5 
 
 
539 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  48.13 
 
 
543 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  48.86 
 
 
540 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  48.39 
 
 
555 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  47.46 
 
 
531 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  48.22 
 
 
542 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  48.7 
 
 
533 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  47.48 
 
 
542 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  48.02 
 
 
536 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  47.48 
 
 
542 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0027  CTP synthetase  50.28 
 
 
543 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  47.83 
 
 
557 aa  490  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  46.73 
 
 
534 aa  489  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0054  CTP synthetase  50.28 
 
 
543 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  48.13 
 
 
542 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  48.88 
 
 
533 aa  490  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0029  CTP synthetase  50.37 
 
 
543 aa  488  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6612  CTP synthetase  48.6 
 
 
550 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174922  hitchhiker  0.00487095 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0908  CTP synthetase  48.97 
 
 
544 aa  488  1e-136  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  48.88 
 
 
538 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  47.91 
 
 
555 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2084  CTP synthetase  48.98 
 
 
544 aa  485  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0736609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  47.16 
 
 
547 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  46.39 
 
 
535 aa  482  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  47.53 
 
 
536 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  47.57 
 
 
543 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  47.75 
 
 
543 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  47.71 
 
 
546 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  47.01 
 
 
543 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  46.98 
 
 
535 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  47.08 
 
 
531 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  48.79 
 
 
547 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  47.53 
 
 
536 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  47.6 
 
 
557 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  46.39 
 
 
535 aa  479  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  46.2 
 
 
535 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  46.39 
 
 
535 aa  481  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  46.2 
 
 
535 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  46.2 
 
 
535 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  46.77 
 
 
555 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  46.2 
 
 
535 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0333  CTP synthetase  48.41 
 
 
542 aa  480  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0791  CTP synthase  49.16 
 
 
534 aa  481  1e-134  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  46.2 
 
 
535 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  47.62 
 
 
537 aa  479  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  46.39 
 
 
535 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  46.39 
 
 
535 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1955  CTP synthetase  48.63 
 
 
530 aa  480  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  48.51 
 
 
533 aa  481  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1393  CTP synthetase  48.48 
 
 
550 aa  481  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438798  normal  0.174623 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  47.07 
 
 
547 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  48.61 
 
 
545 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  48.61 
 
 
545 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  47.07 
 
 
536 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  46.62 
 
 
543 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  48.02 
 
 
555 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  47.57 
 
 
548 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  46.58 
 
 
555 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  47.07 
 
 
547 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0799  CTP synthetase  49.62 
 
 
530 aa  476  1e-133  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000239863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>